RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASC3-201ENST00000264645 UBE3DQ7Z6J8 389 aa13.58□□□□□ -0.24
CASC3-201ENST00000264645 BAGE3Q86Y29 109 aa13.58□□□□□ -0.24
CASC3-201ENST00000264645 BAGE2Q86Y30 109 aa13.58□□□□□ -0.24
CASC3-201ENST00000264645 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.58□□□□□ -0.24
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