RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 EMP2P54851 167 aa11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 ASB10Q8WXI3 467 aa11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 SHARPINQ9H0F6 387 aa11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.1□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM131Q92545 1883 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1W2PR77 199 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 DISC1C4P0D8 188 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 H3BUI4 141 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 OR2T1O43869 369 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 CD27P26842 260 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 LRRC46Q96FV0 321 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1B0GX78 115 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 LMO7DNF2Z398 122 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 H3BMH7 237 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 TRIM77I1YAP6 450 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 PGAM2P15259 253 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF20P17024 532 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 GPR27Q9NS67 375 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.09□□□□□ -0.63
SPIN3-232ENST00000639956 C9orf170A2RU37 121 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 A8MXK9 166 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 HPP00738 406 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 HEXBP07686 556 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 FGF2P09038 288 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 SERPINF1P36955 418 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 CLRN1P58418 232 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 MC2RQ01718 297 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 MYBPHQ13203 477 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 FDX2Q6P4F2 183 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 FAM57BQ71RH2 274 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 RNF222A6NCQ9 220 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR14I1A6ND48 311 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 RPA2P15927 270 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 ARFRP1Q13795 201 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 SGCAQ16586 387 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 SLC25A45Q8N413 288 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 THAP6Q8TBB0 222 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 DCUN1D4Q92564 292 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 GPR84Q9NQS5 396 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11.08□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 F5H5K5 113 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 ZNHIT1O43257 154 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 DUX1O43812 170 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR2J2O76002 312 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 GLI4P10075 376 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 SLC6A9P48067 706 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 DCAF7P61962 342 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF273Q14593 569 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 RAB12Q6IQ22 244 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 PLXDC1Q8IUK5 500 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 LRRC18Q8N456 261 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR4K15Q8NH41 348 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 ELP5Q8TE02 316 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM234Q8WY98 164 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 OR6C1Q96RD1 312 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 KCNK17Q96T54 332 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa11.07□□□□□ -0.64
SPIN3-232ENST00000639956 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms