RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 ESCO2Q56NI9 601 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 PGAP1Q75T13 922 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CYB561A3Q8NBI2 242 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 AQP11Q8NBQ7 271 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2T29Q8NH02 315 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ERGIC1Q969X5 290 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF799Q96GE5 643 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 TSSK6Q9BXA6 273 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 REEP1Q9H902 201 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR76Q9H967 626 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OPN4Q9UHM6 478 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM77I1YAP6 450 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 HAX1O00165 279 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MLNRO43193 412 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 IFNGP01579 166 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ADRA2CP18825 462 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 FPR2P25090 351 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 FMO3P31513 532 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 GATA4P43694 442 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 BLVRAP53004 296 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC25A1P53007 311 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MICAQ29983 383 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC37A3Q8NCC5 494 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2T33Q8NG76 320 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR8D4Q8NGM9 314 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MAP6Q96JE9 813 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC22A4Q9H015 551 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 LRCH1Q9Y2L9 728 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 TVP23AA6NH52 213 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CEACAM18A8MTB9 384 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 F5H5P2 479 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 H0YL77 283 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 FSHBP01225 129 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 IRF2P14316 349 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF12P17014 697 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 DRAM2Q6UX65 266 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MOGAT3Q86VF5 341 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 DEFB108BQ8NET1 73 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ASB9Q96DX5 294 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 LRGUKQ96M69 825 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MRI1Q9BV20 369 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM165Q9HC07 324 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MIOXQ9UGB7 285 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR5V1Q9UGF6 321 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 WNT2P09544 360 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 RAP2AP10114 183 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CD200P41217 278 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ENTPD1P49961 510 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 RAD23AP54725 363 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MS4A2Q01362 244 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF154Q13106 437 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CRMP1Q14194 572 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 PCK2Q16822 640 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 TEX30Q5JUR7 227 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 DCXRQ7Z4W1 244 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 NAA40Q86UY6 237 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR51L1Q8NGJ5 315 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR10S1Q8NGN2 331 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 Q8TCH9 128 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 COPS4Q9BT78 406 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 C1orf21Q9H246 121 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 OPA3Q9H6K4 179 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 NTN4Q9HB63 628 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 MMP26Q9NRE1 261 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 AUP1Q9Y679 476 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 U3KQV3 271 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 RIIAD1A6NNX1 92 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-204ENST00000639439 CD300LBA8K4G0 201 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms