RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PELI1Q96FA3 418 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MND1Q9BWT6 205 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NIPAL2Q9H841 368 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LRRK2Q5S007 2527 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM129A0AVI4 362 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 A6NNC1 897 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TBX1O43435 398 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SMPD2O60906 423 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PNPP00491 289 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NGFP01138 241 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LCKP06239 509 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DCTDP32321 178 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RGS6P49758 472 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 UCP2P55851 309 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 WNT4P56705 351 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 IRF3Q14653 427 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MED22Q15528 200 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 FAM57BQ71RH2 274 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KLBQ86Z14 1044 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPARTQ8N0X7 666 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SVOPQ8N4V2 548 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR52N1Q8NH53 320 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RORBQ92753 470 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PGAM5Q96HS1 289 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 FAM206AQ9NX38 181 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 R4GMQ9 66 aa7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SHISA9B4DS77 424 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 E9PI62 339 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ICMTO60725 284 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PLAUP00749 431 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NR4A1P22736 598 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ANOS1P23352 680 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PCSK6P29122 969 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RAD52P43351 418 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ERVS71-1P61550 626 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DOC2BQ14184 412 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ODF4Q2M2E3 257 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 VHLLQ6RSH7 139 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NEUROG1Q92886 237 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR5M11Q96RB7 305 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR10A2Q9H208 303 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 POFUT1Q9H488 388 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SP140LQ9H930 580 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.9 ms