RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595527.2

TIMM50-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, human

Gene TIMM50, Length 2,274 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM50-205	ENST00000595527	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	WBP1	Q96G27	269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	PDCD5	O14737	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	RAMP1	O60894	148 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	HSF1	Q00613	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	EGR3	Q06889	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527		Q499Y3	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527		L7N2F9	121 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TPPP	O94811	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	IL5	P05113	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SFTPD	P35247	375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	DLX5	P56178	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ZNF208	O43345	1280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	KRT33A	O76009	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TOX	O94900	526 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	OR2A4	O95047	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	MAS1	P04201	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	CCL3	P10147	92 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	MPL	P40238	635 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ZP4	Q12836	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	PLA2G7	Q13093	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	PTHLH	P12272	177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	IL32	P24001	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	DPP4	P27487	766 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	CALCR	P30988	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	BID	P55957	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527		Q6ZTK2	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMM50-205	ENST00000595527	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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