RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52A1Q9UKL2 312 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 HRH3Q9Y5N1 445 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0A6YYJ9 748 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MAS1P04201 325 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 COL8A1P27658 744 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 FAPQ12884 760 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM8Q8N371 416 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51A4Q8NGJ6 313 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PAQR8Q8TEZ7 354 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 DMRTB1Q96MA1 342 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 HRASLSQ9HDD0 168 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A13Q9Y226 551 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 AQP7P3A6NL99 342 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BML4 177 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 H2BFMP0C1H6 154 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 FAUP35544 74 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SSR4P51571 173 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ACER2Q5QJU3 275 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS45Q7RTY3 260 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6M1Q8NGM8 313 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MED30Q96HR3 178 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 GON7Q9BXV9 100 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf198Q9H425 327 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 AUNIPQ9H7T9 357 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1C2O00338 296 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PGA4P0DJD7 388 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PGA3P0DJD8 388 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF17P17021 662 aa22.47■■□□□ 1.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN12P56749 244 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 BCL2L15Q5TBC7 163 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf40Q8WZ69 217 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 HYLS1Q96M11 299 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51J1Q9H342 316 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MED29Q9NX70 200 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL2Q9UKC9 423 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 VAMP5O95183 116 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MECP2P51608 486 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 CLRN1P58418 232 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 FMODQ06828 376 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST3H3Q16695 136 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 GSG1Q2KHT4 349 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf100Q5SVJ3 147 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 BEST3Q8N1M1 668 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM3DQ96BQ1 224 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ABI3Q9P2A4 366 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX15Q9BXT5 2789 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GVI7 797 aa22.46■■□□□ 1.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 TGM6O95932 706 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MLF1P58340 268 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 POU4F3Q15319 338 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 IZUMO1Q8IYV9 350 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM41AQ96HV5 264 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SGCZQ96LD1 299 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MTFP1Q9UDX5 166 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 RCE1Q9Y256 329 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GGT3PA6NGU5 568 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CTAG2O75638 210 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 MPZL1O95297 269 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 DNASE1L1P49184 302 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ELMOD2Q8IZ81 293 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAAF1Q8NEP3 725 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A28Q96A46 364 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SLAMF6Q96DU3 332 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5B2Q96R09 309 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 RBBP9O75884 186 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CSF1P09603 554 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRA1P14867 456 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CD96P40200 585 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 POU3F4P49335 361 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.182e-10■■■■■ 40.3
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF787Q6DD87 383 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 MDS2Q8NDY4 140 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 RELTQ969Z4 430 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF21AQ96BD5 680 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SCPEP1Q9HB40 452 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM206AQ9NX38 181 aa22.44■■□□□ 1.18
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