RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564766.1

FUS-208, Transcript of FUS RNA binding protein, human

TSL 2

Gene FUS, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUS-208	ENST00000564766	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	APOOL	Q6UXV4	268 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	IFNE	Q86WN2	208 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	LACC1	Q8IV20	430 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	STPG4	Q8N801	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	C9orf72	Q96LT7	481 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	RBKS	Q9H477	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	DUX4	Q9UBX2	424 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SNX12	Q9UMY4	172 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	COL6A3	P12111	3177 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	EYS	Q5T1H1	3165 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766		A0A0D9SEW6	157 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SLC22A20	A6NK97	555 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CENPX	A8MT69	81 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	VGLL3	A8MV65	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766		M0QXV9	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PLPP1	O14494	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	TNFSF12	O43508	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MFSD11	O43934	449 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MAGEC1	O60732	1142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	AP2A2	O94973	939 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CLIC3	O95833	236 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ACTL6A	O96019	429 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CD48	P09326	243 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CFC1	P0CG37	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PRSS56	P0CW18	603 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SDC1	P18827	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CNR1	P21554	472 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	FAS	P25445	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	VHL	P40337	213 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	EMP2	P54851	167 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	OR5I1	Q13606	314 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ZIC1	Q15915	447 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	DGUOK	Q16854	277 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	C8orf74	Q6P047	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	SLC35F6	Q8N357	371 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	METTL4	Q8N3J2	472 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	MDS2	Q8NDY4	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ACTL9	Q8TC94	416 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	CDKL2	Q92772	493 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	RPE	Q96AT9	228 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FUS-208	ENST00000564766	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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