RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	FOXF1	Q12946	379 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC10A1	Q14973	349 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SYT14P1	Q58G82	188 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CST9LP1	Q5W188	147 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FAHD1	Q6P587	224 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PFN4	Q8NHR9	129 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM239	Q8WW34	195 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ST8SIA1	Q92185	356 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NR4A3	Q92570	626 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ARL5B	Q96KC2	179 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF597	Q96LX8	424 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf10	Q9HB07	376 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MED31	Q9Y3C7	131 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MED12	Q93074	2177 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP13	Q12802	2813 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FREM3	P0C091	2139 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0J9YW62	118 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A8MVM7	634 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		H0YC42	278 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CDC42EP2	O14613	210 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SNAP29	O95721	258 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	BGLAP	P02818	100 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ANXA8	P13928	327 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KLK2	P20151	261 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GDF1	P27539	372 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A6	P31641	620 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SFTPD	P35247	375 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GPR4	P46093	362 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GSS	P48637	474 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH3A2	P51648	485 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RAD23A	P54725	363 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CTBP2	P56545	445 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IL1RL1	Q01638	556 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ACSM1	Q08AH1	577 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	LY6D	Q14210	128 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF74	Q16587	644 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RAET1L	Q5VY80	246 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SIAH3	Q8IW03	269 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KDM8	Q8N371	416 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79

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