RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557878.5

RNF31-204, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 4

Gene RNF31, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-204	ENST00000557878	ALPL	P05186	524 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	ACHE	P22303	614 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SLC15A1	P46059	708 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CCL8	P80075	99 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	EFNB1	P98172	346 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	RIN1	Q13671	783 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TAF13	Q15543	124 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	DECR2	Q9NUI1	292 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SPRY3	O43610	288 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SELENOF	O60613	162 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CD55	P08174	381 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SLC6A9	P48067	706 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	MALL	Q13021	153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	APOF	Q13790	326 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	NAA40	Q86UY6	237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TEAD3	Q99594	435 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	MSL2	Q9HCI7	577 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	EI24	O14681	340 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	RP2	O75695	350 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	APOC1	P02654	83 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	LYN	P07948	512 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SELE	P16581	610 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	COL8A2	P25067	703 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	OPRL1	P41146	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	CRYBB2	P43320	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	RAD23A	P54725	363 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TMEM33	P57088	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	STMN2	Q93045	179 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	YIPF5	Q969M3	257 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNF31-204	ENST00000557878	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	TACSTD2	P09758	323 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	TNFSF4	P23510	183 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	HSD11B1	P28845	292 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	PRKX	P51817	358 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878		Q6ZR03	302 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	USP51	Q70EK9	711 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	PGAP1	Q75T13	922 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	GID4	Q8IVV7	300 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	OR8G5	Q8NG78	346 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNF31-204	ENST00000557878	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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