RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TAB1	Q15750	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	GABRA6	Q16445	453 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF74	Q16587	644 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	NSMAF	Q92636	917 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A087WUU8	490 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	VCY	O14598	125 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	XKRY	O14609	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ABCD4	O14678	606 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	FFAR1	O14842	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ATP5H	O75947	161 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	QDPR	P09417	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	THRB	P10828	461 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ACADS	P16219	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CCNO	P22674	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CRYGS	P22914	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC9A3	P48764	834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CAMP	P49913	170 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ENTPD1	P49961	510 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	FABP6	P51161	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ART1	P52961	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	IST1	P53990	364 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	VLDLR	P98155	873 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CD47	Q08722	323 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	NPRL3	Q12980	569 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-222	ENST00000553570	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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