RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GVI7 797 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.37□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.37□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.37□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.37□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.37□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD40P25942 277 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WNT5AP41221 380 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGEB1P43366 347 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UCP2P55851 309 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR148Q8TDV2 347 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.232e-7■■□□□ 11.6
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 REEP6Q96HR9 211 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR84Q9NQS5 396 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HHLA2Q9UM44 414 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHDHQ9UQ10 334 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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