RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ATG12	O94817	140 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ICAM2	P13598	275 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ABO	P16442	354 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A1	P53007	311 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PSG6	Q00889	435 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SHE	Q5VZ18	495 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LGI3	Q8N145	548 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TCEAL3	Q969E4	200 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FANCF	Q9NPI8	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IL5	P05113	134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CAMK2B	Q13554	666 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	BAP18	Q8IXM2	172 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SEH1L	Q96EE3	360 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LILRB5	O75023	590 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IGHA1	P01876	353 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HPX	P02790	462 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ADRB1	P08588	477 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ACSM4	P0C7M7	580 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GCH1	P30793	250 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RBP2	P50120	134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HYAL1	Q12794	435 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FZD2	Q14332	565 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CDON	Q4KMG0	1287 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP82	Q8N141	532 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-C	Q95604	372 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SSX3	Q99909	188 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	KCNK15	Q9H427	330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	BCO1	Q9HAY6	547 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EFS	O43281	561 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MPZL1	O95297	269 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CTLA4	P16410	223 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TBXA2R	P21731	343 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RAB4B	P61018	213 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CD226	Q15762	336 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ETFDH	Q16134	617 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LYG2	Q86SG7	212 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CDH26	Q8IXH8	852 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR51H1	Q8NH63	302 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HSPB2	A8KAH6	182 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FAH	P16930	419 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HSPB2	Q16082	182 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	AVPI1	Q5T686	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EXD3	Q8N9H8	876 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GCM1	Q9NP62	436 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ANGPTL7	O43827	346 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NME2P1	O60361	137 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	VAMP5	O95183	116 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GLB1	P16278	677 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MGMT	P16455	207 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FCGR2C	P31995	323 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RAG2	P55895	527 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25

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