RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 YIPF5Q969M3 257 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 TAMM41Q96BW9 452 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 FAF2Q96CS3 445 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 RAB3CQ96E17 227 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 NUS1Q96E22 293 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 GPR137Q96N19 417 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF285Q96NJ3 590 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 OR5M11Q96RB7 305 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 CPXM1Q96SM3 734 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 METTL9Q9H1A3 318 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 POLD4Q9HCU8 107 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 TREX1Q9NSU2 369 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 PRODH2Q9UF12 536 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 NAGKQ9UJ70 344 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 SCML1Q9UN30 329 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 STARD10Q9Y365 291 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 DHRS7Q9Y394 339 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HELTA6NFD8 242 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR2AG2A6NM03 316 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR52A4PA6NMU1 304 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 E7ESA3 106 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 K7EQM0 130 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SH2D1BO14796 132 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR7A10O76100 309 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MBD3O95983 291 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 COX6B1P14854 86 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MAGP20916 626 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ATP6V1C1P21283 382 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MSR1P21757 451 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 DRD5P21918 477 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HSD11B1P28845 292 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 UGT1A3P35503 534 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SLC1A2P43004 574 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MAGEA2P43356 314 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 EMP2P54851 167 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GEMP55040 296 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PKNOX1P55347 436 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NUP107P57740 925 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CXCR4P61073 352 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PSME3P61289 254 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 VSNL1P62760 191 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TNNC1P63316 161 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CSNK1G2P78368 415 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 BAMBIQ13145 260 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ASAH1Q13510 395 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CST6Q15828 149 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 KLHL12Q53G59 568 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ACTBL2Q562R1 376 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GPR107Q5VW38 600 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC66Q68CR7 880 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NIPAL1Q6NVV3 410 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ASRGL1Q7L266 308 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ELMO1Q92556 727 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PHYHIPQ92561 330 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RAB1CQ92928 201 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MYLPFQ96A32 169 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM186Q96B77 213 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM159Q96B96 161 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 S100PBPQ96BU1 408 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PDXPQ96GD0 296 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PRRC1Q96M27 445 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF607Q96SK3 696 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OMDQ99983 421 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms