RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DDO	Q99489	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FN3K	Q9H479	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF121	Q9H920	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SOCS2	O14508	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC22A2	O15244	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RER1	O15258	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SGCE	O43556	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MT-ND5	P03915	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IFNW1	P05000	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LPL	P06858	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GGT2	P36268	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RAD52	P43351	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HTR5A	P47898	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC6A9	P48067	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DGCR6	Q14129	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PDCD1	Q15116	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CT83	Q5H943	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	WDR76	Q9H967	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A0G2JMP0	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A0X1KG70	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1B0GW55	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		A6NIZ1	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		J3QLI3	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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