RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 IL17BQ9UHF5 180 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 KNTC1P50748 2209 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF292O60281 2723 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WUJ7 227 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TRDCB7Z8K6 153 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CASKO14936 926 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 EREGO14944 169 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ARPC5O15511 151 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2A4O95047 310 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GASTP01350 101 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CPN1P15169 458 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MGMTP16455 207 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CD200P41217 278 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PTGDSP41222 190 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MXD1Q05195 221 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ACSM1Q08AH1 577 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RNLSQ5VYX0 342 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GATSQ8NAP1 163 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4K15Q8NH41 348 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM234Q8WY98 164 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ST8SIA1Q92185 356 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM203Q969S6 136 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RELTQ969Z4 430 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM210BQ96KR6 192 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2A7Q96R45 310 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM19Q9H013 955 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRO1933Q9H354 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ABI3Q9P2A4 366 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MED31Q9Y3C7 131 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FRYLO94915 3013 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM186AA6NE01 2351 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R143 59 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF4O43474 513 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GAAP10253 952 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GP1BBP13224 206 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF35P13682 527 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MPGP29372 298 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GSK3AP49840 483 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TDGF1P3P51864 188 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SORDQ00796 357 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 EGR3Q06889 387 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CBLN3Q6UW01 205 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM156Q8N614 296 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMF1Q92530 271 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ATG101Q9BSB4 218 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IFT27Q9BW83 186 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0C4DFX4 3053 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GUH1 482 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM221AA4D161 298 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZAR1LA6NP61 321 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MPZL2O60487 215 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 F10P00742 488 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RPA2P15927 270 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GLP1RP43220 463 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CRISP1P54107 249 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2B8PP59922 312 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GMFBP60983 142 aa6.46□□□□□ -1.37
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