RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 MIOXQ9UGB7 285 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 COL6A5A8TX70 2615 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GGT3PA6NGU5 568 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ZNF878C9JN71 531 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 BHLHE40O14503 412 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GYG2O15488 501 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 XRCC2O43543 280 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 FSTL3O95633 263 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GASTP01350 101 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 IGHV2-70P01814 119 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 HMGN1P05114 100 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DBHP09172 617 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SPARCP09486 303 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ACSM4P0C7M7 580 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ATP6V1B2P21281 511 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 EPHA1P21709 976 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 HSD11B1P28845 292 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DDOSTP39656 456 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ENTPD1P49961 510 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 RASSF2P50749 326 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SLC25A1P53007 311 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SHFQ7M4L6 423 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR6K6Q8NGW6 343 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GIPC3Q8TF64 312 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 BTBD10Q9BSF8 475 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CACNG2Q9Y698 323 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 U3KQV3 271 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 TMEM178BH3BS89 294 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DCTN6O00399 190 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 WNT9BO14905 357 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GMDSO60547 372 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GRK5P34947 590 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 LCN2P80188 198 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR8G1Q15617 311 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SLCO4A1Q96BD0 722 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR8B2Q96RD0 313 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 KCNJ15Q99712 375 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 THTPAQ9BU02 230 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CHID1Q9BWS9 393 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GCM1Q9NP62 436 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DHRS12A0PJE2 317 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GATA4P43694 442 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 MMP16P51512 607 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GNB2P62879 340 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 FLOT2Q14254 428 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 TEX30Q5JUR7 227 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 OTULINQ96BN8 352 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 FN3KQ9H479 309 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ABCB9Q9NP78 766 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CMC2Q9NRP2 79 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 CENPMQ9NSP4 180 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 AUP1Q9Y679 476 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.46□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 A8MXK9 166 aa11.46□□□□□ -0.57
IRF1-210ENST00000493208 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms