RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 UMODP07911 640 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 LAP3P28838 519 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 GNALP38405 381 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 ELP5Q8TE02 316 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 THRSPQ92748 146 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 CMBLQ96DG6 245 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 UBE2QL1A1L167 161 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 ISG15P05161 165 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 PGA4P0DJD7 388 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 PGA3P0DJD8 388 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 FSTP19883 344 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 C4BPBP20851 252 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 CTAG1AP78358 180 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 ACBD4Q8NC06 268 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 KNTC1P50748 2209 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PNV4 684 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 WIPF3A6NGB9 483 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 CSF1P09603 554 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 MMP16P51512 607 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 H2BFSP57053 126 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 ELP2Q6IA86 826 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 GPX8Q8TED1 209 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 NAT6Q93015 286 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 FAM46BQ96A09 425 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 GNRHR2Q96P88 292 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 SPACA5Q96QH8 159 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR2M5A3KFT3 312 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TTLL8A6PVC2 850 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 LDLRAD4O15165 306 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR2A4O95047 310 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 RLN2P04090 185 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 IL5P05113 134 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 FGF5P12034 268 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 BEX5Q5H9J7 111 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 LYPD6Q86Y78 171 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 GABRG1Q8N1C3 465 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 CYYR1Q96J86 154 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 OR2A7Q96R45 310 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 C1orf198Q9H425 327 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-213ENST00000492657 TMEM235A6NFC5 223 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GOSR2O14653 212 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 RER1O15258 196 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 AKAIN1P0CW23 69 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CD37P11049 281 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF35P13682 527 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PMPCAQ10713 525 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 THEM4Q5T1C6 240 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C11orf88Q6PI97 169 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GALNT16Q8N428 558 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 FANCFQ9NPI8 374 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 HPF1Q9NWY4 346 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 D6RAR5 112 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SYT7O43581 403 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms