RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 C20orf202A1L168 122 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PIN1P1O15428 100 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 JTBO76095 146 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF432O94892 652 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 WNT11O96014 354 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CXCL1P09341 107 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OR2T7P0C7T2 308 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ELFN1P0C7U0 828 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF286BP0CG31 522 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PET100P0DJ07 73 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CD37P11049 281 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ST6GAL1P15907 406 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 NPPBP16860 134 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 EGR1P18146 543 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CD22P20273 847 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 BCKDHBP21953 392 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ACRV1P26436 265 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CCKARP32238 428 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 TAS2R50P59544 299 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 IL13RA1P78552 427 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PAX5Q02548 391 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SLC35G3Q8N808 338 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 LFNGQ8NES3 379 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OR2L3Q8NG85 312 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OR2T27Q8NH04 317 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 GPX8Q8TED1 209 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 Q8WTZ3 238 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ASB11Q8WXH4 323 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SMPDL3AQ92484 453 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 FRZBQ92765 325 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SMARCD2Q92925 531 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 RAB8BQ92930 207 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 FBXO32Q969P5 355 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ARSGQ96EG1 525 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PELI1Q96FA3 418 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SPATA33Q96N06 139 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 GPR174Q9BXC1 333 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 KATNBL1Q9H079 304 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 DPEP2Q9H4A9 486 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 MED20Q9H944 212 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CHODLQ9H9P2 273 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 MSL2Q9HCI7 577 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 VAX2Q9UIW0 290 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 DKKL1Q9UK85 242 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 CKAP5Q14008 2032 aa3.28□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.28□□□□□ -1.88
FUBP1-211ENST00000489495 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms