RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TPST2O60704 377 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 DIRAS1O95057 198 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 SYNGR4O95473 234 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 UBL4AP11441 157 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 FPR3P25089 353 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 IL12BP29460 328 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT20P35900 424 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 CXCR4P61073 352 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 NPRL3Q12980 569 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 SKP2Q13309 424 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 NNATQ16517 81 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 CCNJQ5T5M9 372 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 AVPI1Q5T686 147 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF691Q5VV52 312 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT80Q6KB66 452 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 Q6ZSV7 163 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 YIPF5Q969M3 257 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ADGRG7Q96K78 797 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 RCHY1Q96PM5 261 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 MBOAT4Q96T53 435 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 FEVQ99581 238 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 MCHR1Q99705 422 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 AUP1Q9Y679 476 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A087WUU8 490 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ZAR1LA6NP61 321 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 H3BNH8 94 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 FADS1O60427 444 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 MPZL2O60487 215 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 SPDEFO95238 335 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 LYPD3O95274 346 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 UTS2O95399 124 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 CSTAP01040 98 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OPN1LWP04000 364 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 LYNP07948 512 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ADRA2AP08913 450 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 CCDC159P0C7I6 412 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 COX5AP20674 150 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ACHEP22303 614 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 GSSP48637 474 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 UGT2B15P54855 530 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TAS2R41P59536 307 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 GABARAPL2P60520 117 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TUBA4AP68366 448 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TSPAN31Q12999 210 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OR1Q1Q15612 314 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 FGD3Q5JSP0 725 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ULK3Q6PHR2 472 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4C3Q8NH37 302 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 LIPHQ8WWY8 451 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 RAB39BQ96DA2 213 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OMA1Q96E52 524 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 APOL4Q9BPW4 351 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 LAT2Q9GZY6 243 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A087WUJ7 227 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF264O43296 627 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 TRIAP1O43715 76 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 OR10H3O60404 316 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDMT1-210ENST00000488990 GPR137BO60478 399 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms