RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 LIPT2A6NK58 231 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 H3BUI4 141 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CTAG2O75638 210 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 IGHMP01871 453 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 LPLP06858 475 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GTF2F2P13984 249 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ADRA2CP18825 462 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CXCL2P19875 107 aa8.54□□□□□ -1.04
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POLR1A-208ENST00000486964 GRPRP30550 384 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SOX2P48431 317 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CYB561P49447 251 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ROM1Q03395 351 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MESTQ5EB52 335 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MTFR2Q6P444 385 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf88Q6PI97 169 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMUB2Q71RG4 321 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF511Q8NB15 262 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PTX4Q96A99 478 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ARL5BQ96KC2 179 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GNRHR2Q96P88 292 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR8B4Q96RC9 309 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf198Q9H425 327 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 EXO5Q9H790 373 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CA10Q9NS85 328 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DEPPQ9NTK1 212 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 WASF3Q9UPY6 502 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 VDAC3Q9Y277 283 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0D9SG52 128 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0G2JMM0 328 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPB8 328 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PRS3 328 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.53□□□□□ -1.04
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POLR1A-208ENST00000486964 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NKX2-8O15522 239 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A12O75746 678 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 AHSA1O95433 338 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 WDPCPO95876 746 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 P04436 131 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RLN1P04808 185 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GABRA1P14867 456 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PTGS2P35354 604 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 POU3F4P49335 361 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 P2RY4P51582 365 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CLDN12P56749 244 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CLN3Q13286 438 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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POLR1A-208ENST00000486964 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RAB12Q6IQ22 244 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GALNT16Q8N428 558 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RNF128Q8TEB7 428 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DDIT4LQ96D03 193 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ORAI1Q96D31 301 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.53□□□□□ -1.04
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