RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPL8 197 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 OR6C6A6NF89 314 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 A6NJ64 397 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 STMND1H3BQB6 276 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 H7C417 338 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ACOT7O00154 380 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 TM4SF5O14894 197 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 CCNKO75909 580 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 NME2P22392 152 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 CD82P27701 267 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 UNC119Q13432 240 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ8Q15842 424 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 RAB11BQ15907 218 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 BCL2A1Q16548 175 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 CARD17Q5XLA6 110 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ENKURQ8TC29 256 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 GPX8Q8TED1 209 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 HES7Q9BYE0 225 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 HDHD2Q9H0R4 259 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 NELFAQ9H3P2 528 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 LRFN1Q9P244 771 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 COPZ2Q9P299 210 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF221Q9UK13 617 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 V9GYS6 101 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 OR5H15A6NDH6 313 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 NAP1L6A6NFF2 107 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF726A6NNF4 738 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.95□□□□□ -1.62
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