RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFS8O00217 210 aa13.07□□□□□ -0.32
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFS7O75251 213 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T7P0C7T2 308 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFL1P23528 166 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V1E1P36543 226 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CX3CR1P49238 355 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP15P51511 669 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKXP51817 358 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EGR3Q06889 387 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC12BQ2HXU8 276 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT77Q7Z794 578 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T27Q8NH04 317 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMELYQ99218 206 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROQ9BYG7 248 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGCCQ9H4X1 137 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA4P78363 2273 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKAP9Q99996 3911 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACOD1A6NK06 481 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XRCC2O43543 280 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSX4O60224 188 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENTPD6O75354 484 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GABRB1P18505 474 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTNR1AP48039 350 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF81P51508 661 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL18R1Q13478 541 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGAP1Q75T13 922 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATC1Q76KD6 591 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35F2Q8IXU6 374 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD9Q8NE22 299 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITFG2Q969R8 447 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPSB4Q96A44 273 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q96MF0 132 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8B4Q96RC9 309 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POFUT1Q9H488 388 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTTG3PQ9NZH4 202 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.05□□□□□ -0.32
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YAE9 185 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YJX3 145 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAT2P11245 290 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOSL1P15407 271 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDLIM4P50479 330 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTC1P68032 377 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTA1P68133 377 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIPK1Q13546 671 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4orf48Q5BLP8 95 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS45Q7RTY3 260 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAA40Q86UY6 237 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHRSXQ8N5I4 330 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF540Q8NDQ6 660 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2FQ969M7 185 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10A2Q9H208 303 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCX3BQ9H321 246 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPK1Q9H3S4 243 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP12Q9Y561 859 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRBAP50851 2863 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD55P08174 381 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAOP14920 347 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A16P16260 332 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDOSTP39656 456 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIDAP52758 137 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXCR4P61073 352 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK5R2Q13319 367 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01559Q495D7 138 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM255AQ5JRV8 349 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF691Q5VV52 312 aa13.04□□□□□ -0.32
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