RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 SPATS1Q496A3 300 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MAP6Q96JE9 813 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 DDOQ99489 341 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 A0A1B0GWJ7 208 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LRRC30A6NM36 301 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 A8MXK9 166 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 BHLHE40O14503 412 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 DCTN3O75935 186 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PYCR1P32322 319 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TPTEP56180 551 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MAB21L1Q13394 359 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF181Q2M3W8 571 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LINC00471Q8N535 108 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MRI1Q9BV20 369 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TRIM15Q9C019 465 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 IL20Q9NYY1 176 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 NUP50Q9UKX7 468 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TVP23AA6NH52 213 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 B2RBV5 119 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CPT2P23786 658 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CD80P33681 288 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 GATA4P43694 442 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MNAT1P51948 309 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PAX8Q06710 450 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 FAM201AQ5SY85 155 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PGAP1Q75T13 922 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 KLBQ86Z14 1044 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 C1orf87Q8N0U7 546 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 C3orf56Q8N813 242 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 SPTSSAQ969W0 71 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF69Q9UC07 566 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MIOXQ9UGB7 285 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 KCNG2Q9UJ96 466 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.92□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 M0R135 149 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CCNB2O95067 398 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 FSTL3O95633 263 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ATP6V1B2P21281 511 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MAGEA2P43356 314 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 GNB2P62879 340 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF404Q494X3 552 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR2T4Q8NH00 348 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF799Q96GE5 643 aa11.91□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 IRF2P14316 349 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CA6P23280 308 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 CD200P41217 278 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PAX2Q02962 417 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF92Q03936 586 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 LNX2Q8N448 690 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 FITM2Q8N6M3 262 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ZNF511Q8NB15 262 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 AQP11Q8NBQ7 271 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 ERGIC1Q969X5 290 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.9□□□□□ -0.5
NELFE-201ENST00000375425 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms