RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND4AQ7Z401 1863 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GW55 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMCO2A6NFE2 343 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5H1A6NKK0 313 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC169A6NNP5 214 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf51A8MQB3 221 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRBOX1C9JBD0 128 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMKR1H3BMG3 65 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C417 338 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLSO94925 669 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAHP00439 452 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV6-57P01721 117 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT14P02533 472 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FTH1P02794 183 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4L2P0CJ85 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4L3P0CJ86 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4L5P0CJ88 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4L6P0CJ89 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4L7P0CJ90 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATF6P18850 670 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP4Q02446 784 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGM3Q08188 693 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC74AQ0VAA2 488 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 YIF1BQ5BJH7 314 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOHLH1Q5JUK2 328 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF20Q5VT98 475 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3F3CQ6NXT2 135 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35G3Q8N808 338 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR11H7Q8NGC8 314 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM2D3Q9BRN9 247 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHCHD7Q9BUK0 85 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD60Q9BZ19 345 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTCH1Q9NZJ7 389 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4Q9UBX2 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTFP1Q9UDX5 166 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PITPNC1Q9UKF7 332 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD51CO43502 376 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHMP2AO43633 222 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN11O75508 207 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP8O94778 261 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARG1P05089 322 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM34P42696 430 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARD17Q5XLA6 110 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC66Q68CR7 880 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC23LQ6PF05 361 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPSR1Q6W5P4 371 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM136Q6ZRR5 245 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CMC1Q7Z7K0 106 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CMTM1Q8IZ96 169 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPWQ8N729 165 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf72Q8NBR9 251 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5T1Q8NG75 326 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52E2Q8NGJ4 325 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10G6Q8NH81 332 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUBPLQ8TB37 319 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 APH1BQ8WW43 257 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf24Q9BUV8 137 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRA2Q9H9E1 313 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK6Q9HC98 313 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMRK1Q9NWW6 199 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTBP4Q8N2S1 1624 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCN4AP35499 1836 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 A6NDN8 102 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2AG2A6NM03 316 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEACAM18A8MTB9 384 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF878C9JN71 531 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C0C1 242 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7EMT4 169 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP3B1O00203 1094 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MANBAO00462 879 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSM1O15116 133 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLIN3O60664 434 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2F2O95006 317 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGTP01019 485 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LHBP01229 141 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYKP43405 635 aa1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms