RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356162.5

CNOT4-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 2,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-202ENST00000356162 DOK1Q99704 481 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 KCNJ15Q99712 375 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 SYT3Q9BQG1 590 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 VCXQ9H320 206 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 OPA3Q9H6K4 179 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 NIPAL2Q9H841 368 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 SP140LQ9H930 580 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.4□□□□□ -1.86
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CNOT4-202ENST00000356162 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.4□□□□□ -1.86
CNOT4-202ENST00000356162 FBN2P35556 2912 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 CADP27708 2225 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 AKAP9Q99996 3911 aa3.4□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 SLC16A6O15403 523 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 IGHV4-39P01824 125 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 MT-ND5P03915 603 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 LYNP07948 512 aa3.4□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 SELEP16581 610 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 KITLGP21583 273 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 LIPAP38571 399 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 MPV17P39210 176 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 OPRL1P41146 370 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 SLC15A1P46059 708 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 EFNA4P52798 201 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ERVS71-1P61550 626 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TAF13Q15543 124 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 FAM209AQ5JX71 171 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.4□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.4□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 SLC29A1Q99808 456 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ABHD6Q9BV23 337 aa3.4□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 POFUT1Q9H488 388 aa3.4□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ABCA4P78363 2273 aa3.4□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ACOD1A6NK06 481 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 SNTNA6NMZ2 147 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 XRCC2O43543 280 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ADH4P08319 380 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 HSD11B1P28845 292 aa3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 CX3CR1P49238 355 aa3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 IL18R1Q13478 541 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TTC23Q5W5X9 447 aa3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 LRP11Q86VZ4 500 aa3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
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CNOT4-202ENST00000356162 DIRC2Q96SL1 478 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 TEAD3Q99594 435 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 APOL4Q9BPW4 351 aa3.39□□□□□ -1.87
CNOT4-202ENST00000356162 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.39□□□□□ -1.87
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