RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 NECAP1Q8NC96 275 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 PCK2Q16822 640 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 OR1C1Q15619 314 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRM-201ENST00000332175 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRM-201ENST00000332175 MVB12AQ96EY5 273 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 CBR3O75828 277 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 AVPI1Q5T686 147 aa20.23■□□□□ 0.83
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