RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299299.3

PCBD1-201, Transcript of pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCBD1, Length 1,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBD1-201ENST00000299299 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 BLOC1S6Q9UL45 172 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 JMJD1CQ15652 2540 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 IGHV4-39P01824 125 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 STOMP27105 288 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 TTKP33981 857 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 HTR5AP47898 357 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ETV1P50549 477 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 CHN2P52757 468 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 PLP2Q04941 152 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 EGR3Q06889 387 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ECH1Q13011 328 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 GALEQ14376 348 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 CDONQ4KMG0 1287 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 AGAP6Q5VW22 663 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 MUC15Q8N387 334 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 SLC7A6Q92536 515 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 POM121L2Q96KW2 1035 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ALG8Q9BVK2 526 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 CENPMQ9NSP4 180 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 ATP23Q9Y6H3 246 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBD1-201ENST00000299299 PSMD9O00233 223 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 RGS10O43665 173 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 NDUFS7O75251 213 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ABHD16AO95870 558 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 PTHP01270 115 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 DBHP09172 617 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 MYL12AP19105 171 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 FABP6P51161 128 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 HGFACQ04756 655 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 IRF3Q14653 427 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 RNLSQ5VYX0 342 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF544Q6NX49 715 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 KRT77Q7Z794 578 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CLEC2DQ9UHP7 191 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 LRP12Q9Y561 859 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF254O75437 659 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 SULT1C4O75897 302 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 MT-ND2P03891 347 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 H2BFMP0C1H6 154 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ACSM4P0C7M7 580 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CCL2P13500 99 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF35P13682 527 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CALCRP30988 508 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 APLNRP35414 380 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CDH15P55291 814 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 OR12D2P58182 307 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 NAAAQ02083 359 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 TAF13Q15543 124 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 TP53I3Q53FA7 332 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 PRSS48Q7RTY5 328 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 SYS1Q8N2H4 156 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 SNX33Q8WV41 574 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 KCNJ15Q99712 375 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 MROQ9BYG7 248 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 ARID1AO14497 2285 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 USF3Q68DE3 2245 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 TMEM129A0AVI4 362 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 C5orf49A4QMS7 147 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 METTL15A6NJ78 407 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 F5H5K5 113 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBD1-201ENST00000299299 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms