RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ZNF785A8K8V0 405 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LY86O95711 162 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PTTG1IPP53801 180 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SAXO2Q658L1 398 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 EXD3Q8N9H8 876 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PFN4Q8NHR9 129 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GMLQ99445 158 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SOD1P00441 154 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.51□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CDK5Q00535 292 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 VAMP3Q15836 100 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMUB2Q71RG4 321 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NRG4Q8WWG1 115 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RASD2Q96D21 266 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 A0A087WV62 115 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PGGT1BP53609 377 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM129A0AVI4 362 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TNFSF15O95150 251 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 METRNLQ641Q3 311 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF425Q6IV72 752 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NTF3P20783 257 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GPR3P46089 330 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PKMYT1Q99640 499 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SRRQ9GZT4 340 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 BANF2Q9H503 90 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF716A6NP11 495 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SHC1P29353 583 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CSNK1G2P78368 415 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DUSP8Q13202 625 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 A0A0U1RQS6 177 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DPTQ07507 201 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR6C68A6NDL8 312 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 AFMIDQ63HM1 303 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MENTQ9BUN1 341 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 UBQLN3Q9H347 655 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SELENBP1Q13228 472 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.5□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RRASP10301 218 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 COX20Q5RI15 118 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MOB3BQ86TA1 216 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SRFP11831 508 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DEFB103AP81534 67 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HAGHQ16775 308 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM65Q6PI78 240 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM56Q96MV1 263 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GPR173Q9NS66 373 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FRG2CA6NGY1 282 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 I6L893 689 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SIAH2O43255 324 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PTGER1P34995 402 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 KMT5CQ86Y97 462 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC39A13Q96H72 371 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.49□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms