RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAS1P04201 325 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ELK1P19419 428 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 EVX1P49640 407 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PSG4Q00888 419 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HGFACQ04756 655 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MADCAM1Q13477 382 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GUSBP1Q15486 140 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NRN1LQ496H8 165 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SARAFQ96BY9 339 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAXQ9Y2V3 346 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 V9GY05 133 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 F5H5K5 113 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 AIPO00170 330 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TBX1O43435 398 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SGCEO43556 437 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 UPK1BO75841 260 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FCGR2AP12318 317 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FAPQ12884 760 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CNIH2Q6PI25 160 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CITED4Q96RK1 184 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIB1Q96RU8 372 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRQ9GZT4 340 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6C6A6NF89 314 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB35Q15286 201 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 STK11Q15831 433 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HES5Q5TA89 166 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MZT2AQ6P582 158 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM57BQ71RH2 274 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MALT1Q9UDY8 824 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A096LPE4 126 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPZ6 126 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NIN4 97 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD5O14737 125 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV3-1P01715 115 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN12P56749 244 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 STEAP3Q658P3 488 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 THRSPQ92748 146 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FABP12A6NFH5 140 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT7O43581 403 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 IL18BPO95998 194 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FSTP19883 344 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY14Q15391 338 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DTX3Q8N9I9 347 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SUN5Q8TC36 379 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LYZL4Q96KX0 146 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLITRK2Q9H156 845 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR84Q9NQS5 396 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 UPB1Q9UBR1 384 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR14I1A6ND48 311 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms