RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 LGALS8O00214 317 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ZNF529Q6P280 563 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CHST4Q8NCG5 386 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PHYHIPLQ96FC7 376 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PHB2Q99623 299 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 GPR160Q9UJ42 338 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TRIOO75962 3097 aa24.91■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C2orf72A6NCS6 295 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 RAB3AP20336 220 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 BIDP55957 195 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FOXF1Q12946 379 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ARSKQ6UWY0 536 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 LDAHQ9H6V9 325 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 MOB1AQ9H8S9 216 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 IFT46Q9NQC8 304 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 VDAC3Q9Y277 283 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C9orf170A2RU37 121 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TSPAN4O14817 238 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 STK17BO94768 372 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 VSIG8P0DPA2 414 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 BCKDHBP21953 392 aa24.9■■□□□ 1.58
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UBP1-201ENST00000283628 PPP1R1AQ13522 171 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 MRGPRFQ96AM1 343 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CST11Q9H112 138 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TMEM185BQ9H7F4 350 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SERINC1Q9NRX5 453 aa24.9■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTS20P59510 1910 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TAF13Q15543 124 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 THEM4Q5T1C6 240 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB44Q8NCP5 570 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 RNF138Q8WVD3 245 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.89■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FOSL2P15408 326 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 LAP3P28838 519 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 IL13RA1P78552 427 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 MOB3CQ70IA8 216 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 OR10K1Q8NGX5 313 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 CMBLQ96DG6 245 aa24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa24.88■■□□□ 1.57
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UBP1-201ENST00000283628 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 PTGES2Q9H7Z7 377 aa24.88■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.88■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 CDK2AP1O14519 115 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 MSX1P28360 303 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 STARP49675 285 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A53Q5H9E4 307 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 OR10S1Q8NGN2 331 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 OR10R2Q8NGX6 335 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 DNASE2BQ8WZ79 361 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 MRGPRX4Q96LA9 322 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa24.87■■□□□ 1.57
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UBP1-201ENST00000283628 TMEM14DPA8MWL7 114 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 CCSO14618 274 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 HRH1P35367 487 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 DLSTP36957 453 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 OR52W1Q6IF63 320 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 RHOUQ7L0Q8 258 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 PMEPA1Q969W9 287 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.87■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 TRIM77I1YAP6 450 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 K7ESF4 209 aa24.86■■□□□ 1.57
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UBP1-201ENST00000283628 CHRM2P08172 466 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 LIPCP11150 499 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 AWAT2Q6E213 333 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 OR2W3Q7Z3T1 314 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 STPG2Q8N412 459 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 EMC6Q9BV81 110 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 H3BML4 177 aa24.85■■□□□ 1.57
UBP1-201ENST00000283628 TEX46H3BTG2 121 aa24.85■■□□□ 1.57
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