RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.66□□□□□ -0.86
GGPS1-201ENST00000282841 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.66□□□□□ -0.86
GGPS1-201ENST00000282841 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.66□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 PTHLHP12272 177 aa9.66□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-201ENST00000282841 SPOCK1Q08629 439 aa9.65□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.65□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.65□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 R4GMQ9 66 aa9.65□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 PHYHO14832 338 aa9.65□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.65□□□□□ -0.86
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GGPS1-201ENST00000282841 ACOT7O00154 380 aa9.65□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 ARL6IP5O75915 188 aa9.65□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 HRGP04196 525 aa9.65□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 GLAP06280 429 aa9.65□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 POU4F3Q15319 338 aa9.65□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.65□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 NELFAQ9H3P2 528 aa9.65□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 FAM206AQ9NX38 181 aa9.65□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.65□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 PRSS50Q9UI38 385 aa9.65□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF98A6NK75 572 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 UPK1BO75841 260 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 ACSM4P0C7M7 580 aa9.64□□□□□ -0.87
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