RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 FDX2Q6P4F2 183 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF773Q6PK81 442 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SVOPQ8N4V2 548 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 NUP37Q8NFH4 326 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 RORBQ92753 470 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM206AQ9NX38 181 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 BABAM2Q9NXR7 383 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 PTPN13Q12923 2485 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SMPD2O60906 423 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 SHISA9B4DS77 424 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 PNPP00491 289 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC58Q4VC31 144 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ADAM5Q6NVV9 412 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF544Q6NX49 715 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 HS3ST6Q96QI5 342 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 NGFP01138 241 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM157BP0CG42 384 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC2A1P11166 492 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 GLRXP35754 106 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 TGM4P49221 684 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CDH15P55291 814 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RPS23P62266 143 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 SPHARQ15513 63 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 SPARTQ8N0X7 666 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ABHD4Q8TB40 342 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 BRD7Q9NPI1 651 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 A0A087WXM4 84 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CCR9P51686 369 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ACSM1Q08AH1 577 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM57BQ71RH2 274 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 PGAM5Q96HS1 289 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 G6PC2Q9NQR9 355 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 STARD10Q9Y365 291 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 PSMB10P40306 273 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 TAS2R43P59537 309 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 PPP1CBP62140 327 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 BDH1Q02338 343 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 MALLQ13021 153 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 SNAI3Q3KNW1 292 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 KLBQ86Z14 1044 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR10A2Q9H208 303 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RGCCQ9H4X1 137 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 VSTM5A8MXK1 200 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 H3BSA7 217 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 XRCC2O43543 280 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CTAG2O75638 210 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 LCKP06239 509 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR51B6Q9H340 312 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CA10Q9NS85 328 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 A0A0U1RQV5 110 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 PLAUP00749 431 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 COL8A1P27658 744 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 MAP2K4P45985 399 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 MED22Q15528 200 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 FCGR1BQ92637 280 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 C14orf79Q96F83 325 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OR5M11Q96RB7 305 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 OPA3Q9H6K4 179 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 FRRS1LQ9P0K9 344 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms