RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ASF1BQ9NVP2 202 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM72A0PK05 275 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR32B1ATL7 298 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TOR1AO14656 332 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO45P0C2W1 286 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 RFC3P40938 356 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FGL1Q08830 312 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SFRP5Q5T4F7 317 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 WBP2NLQ6ICG8 309 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FDX2Q6P4F2 183 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN5Q6U736 354 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKAL2Q6UX46 152 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5M1Q8NGP8 315 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR76Q9H967 626 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMP5Q9UJQ1 280 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A23A1A5C7 686 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PINLYPA6NC86 204 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL4AA6NLU0 287 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RPP14O95059 124 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PMS2P2O95744 297 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RLN1P04808 185 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 UBBP0CG47 229 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF35P13682 527 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 UBA52P62987 128 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TLE1Q04724 770 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOA3BQ3SY89 546 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC75AQ8NAA5 344 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOA3Q8NG57 546 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2G2Q8NGZ5 317 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MCHR2Q969V1 340 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 Q96M85 177 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 FXYD6Q9H0Q3 95 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GNB5O14775 395 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 NME2P1O60361 137 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAG2O75638 210 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CD46P15529 392 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 NME2P22392 152 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS3P35030 304 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ADH7P40394 386 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFBP7Q16270 282 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF74Q16587 644 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF20Q5VT98 475 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SULF2Q8IWU5 870 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF676Q8N7Q3 588 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ARSGQ96EG1 525 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D2AQ9NP31 389 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0D9SG52 128 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 FRG2CA6NGY1 282 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BUI4 141 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GOSR2O14653 212 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG10Q5BKT4 473 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CLVS2Q5SYC1 327 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF511Q8NB15 262 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52B4Q8NGK2 314 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1S1Q8NH92 325 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf34Q96MH7 638 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PROK2Q9HC23 129 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MGMTP16455 207 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX2P48431 317 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RNFT1Q5M7Z0 435 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF454Q8N9F8 522 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CPT1CQ8TCG5 803 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEKPQ9BYX7 375 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MFFQ9GZY8 342 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZGRF1Q86YA3 2104 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD9O00233 223 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2F2P13984 249 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MPGP29372 298 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GRPRP30550 384 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB1P43366 347 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCXD2Q0VAA5 305 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 LPCAT3Q6P1A2 487 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM106AQ96A25 262 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SCPEP1Q9HB40 452 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RENP00797 406 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PTHLHP12272 177 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF7P61962 342 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ADOQ96SZ5 270 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM138Q9NPI0 162 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GRHPRQ9UBQ7 328 aa23.35■■□□□ 1.33
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