RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 CXorf65A6NEN9 183 aa14.69□□□□□ -0.06
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LRP11-201ENST00000239367 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
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LRP11-201ENST00000239367 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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LRP11-201ENST00000239367 GSK3AP49840 483 aa14.66□□□□□ -0.06
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