RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-229	ENST00000638939		Q6ZR03	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NSMAF	Q92636	917 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CITED1	Q99966	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PHYH	O14832	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ANGPT2	O15123	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	AHCYL1	O43865	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DOK2	O60496	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NDUFA7	O95182	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	KNG1	P01042	644 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	WNT2	P09544	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	FUT1	P19526	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CD80	P33681	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	GDNF	P39905	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	HTR5A	P47898	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	GZMM	P51124	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RAG2	P55895	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MXRA7	P84157	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	AQP6	Q13520	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NFYC	Q13952	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SELPLG	Q14242	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SGCA	Q16586	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MMP27	Q9H306	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939		H3BUI4	141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939		M0QZ24	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	FXYD1	O00168	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	TIMM23	O14925	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	SGCE	O43556	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC9A3	P48764	834 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDE4D-229	ENST00000638939	RGS6	P49758	472 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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