RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS47	A8MTI9	375 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HDAC3	O15379	428 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	KCNK2	O95069	426 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UTS2	O95399	124 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TGDS	O95455	350 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OPN1SW	P03999	348 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	THRB	P10828	461 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PRPS2	P11908	318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ME2	P23368	584 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GABRA3	P34903	492 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	KRT20	P35900	424 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HPCAL1	P37235	193 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEA8	P43361	318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PNLIPRP2	P54317	469 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK11	Q15759	364 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SMU1	Q2TAY7	513 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GTDC1	Q4AE62	458 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CPTP	Q5TA50	214 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HHAT	Q5VTY9	493 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD46	Q86W74	232 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf111	Q8N326	155 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CDS1	Q92903	461 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	APH1A	Q96BI3	265 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TESC	Q96BS2	214 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RNFT2	Q96EX2	444 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TXNDC15	Q96J42	360 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	EBF4	Q9BQW3	602 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CFL2	Q9Y281	166 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PPW3	197 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768		E9PBE3	544 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NR5A2	O00482	541 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	EFNA2	O43921	213 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR12D1	P0DN82	309 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LBP	P18428	481 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PRPS1L1	P21108	318 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CRYBB2	P43320	205 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FGF12	P61328	243 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF117	Q03924	483 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK14	Q16539	360 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CGB2	Q6NT52	195 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CDC73	Q6P1J9	531 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	EPGN	Q6UW88	154 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SZRD1	Q7Z422	152 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CROCCP2	Q86T23	111 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SLC43A2	Q8N370	569 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GATS	Q8NAP1	163 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GPR151	Q8TDV0	419 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CCL17	Q92583	94 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	VPS33A	Q96AX1	596 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C7orf26	Q96N11	449 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC115	Q96NT0	180 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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