RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM10	O14672	748 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	EFNA2	O43921	213 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SFTPC	P11686	197 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CPN1	P15169	458 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	KLK2	P20151	261 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	DLX5	P56178	289 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RAP2B	P61225	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MFAP5	Q13361	173 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	FDX2	Q6P4F2	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341		Q7L0L9	218 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CYB5A	P00167	134 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SORD	Q00796	357 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	PMPCA	Q10713	525 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MYBPH	Q13203	477 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	LIN54	Q6MZP7	749 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OPN4	Q9UHM6	478 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341		F5H5P2	479 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SYT7	O43581	403 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	IL5	P05113	134 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CAPZA1	P52907	286 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341		A6NIZ1	184 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	LGALS8	O00214	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	CCS	O14618	274 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	ACTB	P60709	375 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SMTN-222	ENST00000612341	RAP1B	P61224	184 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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