RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 BTBD16Q32M84 506 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CD276Q5ZPR3 534 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GLCCI1Q86VQ1 547 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 UEVLDQ8IX04 471 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF133Q8WVZ7 376 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GHITMQ9H3K2 345 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 HHLA2Q9UM44 414 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf72A6NCS6 295 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 EFNA2O43921 213 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 F10P00742 488 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 IL11P20809 199 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP16P51512 607 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 IFITM2Q01629 132 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ETFDHQ16134 617 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GLT8D1Q68CQ7 371 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM166AQ6J272 317 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD16Q6P6B7 361 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 NPAS1Q99742 590 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 STMN3Q9NZ72 180 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC4AQ9UMR7 237 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.53■■□□□ 1.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPS27P42677 84 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 GZMKP49863 264 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY4P51582 365 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TDGF1P3P51864 188 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCZ1Q86YW0 608 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6X1Q8NH79 312 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB5Q8WWX0 329 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ORAI1Q96D31 301 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OXGR1Q96P68 337 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SLA2Q9H6Q3 261 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R8Q9NYW2 309 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GTH9 108 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPP00491 289 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHG1P01857 330 aa22.51■■□□□ 1.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35A1P78382 337 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB11BQ15907 218 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 FGD2Q7Z6J4 655 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 DTX3Q8N9I9 347 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10AC1Q8NH08 325 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MOB1AQ9H8S9 216 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 EMC7Q9NPA0 242 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 DIABLOQ9NR28 239 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0A6YYH2 397 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5H15A6NDH6 313 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NJ64 397 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 H2AFB2P0C5Z0 115 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 LAP3P28838 519 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R20P59543 309 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 CD83Q01151 205 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TNK1Q13470 666 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNMB1Q16558 191 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR7E24Q6IFN5 339 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 NKAIN3Q8N8D7 197 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 WDSUB1Q8N9V3 476 aa22.5■■□□□ 1.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT15Q9NV35 164 aa22.5■■□□□ 1.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 STOMP27105 288 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 GIFP27352 417 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 BIDP55957 195 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM225Q6GV28 225 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 DCXRQ7Z4W1 244 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52I2Q8NH67 350 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFAND1Q8TCF1 268 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PTX4Q96A99 478 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJA3Q96EY1 480 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 G6PC2Q9NQR9 355 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MCUBQ9NWR8 336 aa22.5■■□□□ 1.19
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