RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCCSP53701 268 aa28.46■■■□□ 2.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFLNBQ8N5W9 214 aa28.38■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXC2Q99958 501 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 POFUT1Q9H488 388 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRP12Q9Y561 859 aa28.38■■■□□ 2.13
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