RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 GSTT1P30711 240 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MPV17P39210 176 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF81P51508 661 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TPTEP56180 551 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HIST1H3AP68431 136 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SPATC1Q76KD6 591 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SHFQ7M4L6 423 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CPOQ8IVL8 374 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PARP8Q8N3A8 854 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 THEM6Q8WUY1 208 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 DDOQ99489 341 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PKP2Q99959 881 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 COPS4Q9BT78 406 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 WDR76Q9H967 626 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 STARD10Q9Y365 291 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.66□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 C17orf100A8MU93 164 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF878C9JN71 531 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 H3BSA7 217 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 J3QW42 95 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 M0R135 149 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 NDUFS8O00217 210 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PRODHO43272 600 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TBX1O43435 398 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SPRY3O43610 288 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 BAG2O95816 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 IGHV3-13P01766 116 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TNFSF4P23510 183 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 GGT2P36268 569 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LIPAP38571 399 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MAGEB1P43366 347 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLC15A1P46059 708 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PRKXP51817 358 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RAD23AP54725 363 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CCL8P80075 99 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MALLQ13021 153 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 APOFQ13790 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 GGTLC2Q14390 218 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR5AS1Q8N127 324 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PTP4A1Q93096 173 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CMBLQ96DG6 245 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF799Q96GE5 643 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MAP6Q96JE9 813 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CIB1Q99828 191 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 S100A14Q9HCY8 104 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 H3BNX3 289 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 EI24O14681 340 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SELENOFO60613 162 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ICMTO60725 284 aa6.64□□□□□ -1.35
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