RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571507.5

P4HB-215, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 2

Gene P4HB, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-215	ENST00000571507	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SMIM11A	P58511	58 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	GNB2	P62879	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	COX10	Q12887	443 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MALL	Q13021	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MEP1B	Q16820	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	RFX4	Q33E94	735 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	PITX2	Q99697	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	GPA33	Q99795	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ATF6B	Q99941	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	WDR76	Q9H967	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507		F5H5K5	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507		F5H5P2	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ARPC2	O15144	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ARPC3	O15145	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MLNR	O43193	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	OR10H3	O60404	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF205	O95201	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	FSTL3	O95633	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SEMG1	P04279	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	FABP3	P05413	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	IRF2	P14316	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	CPT2	P23786	658 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	PRTN3	P24158	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	RRM2	P31350	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	RAD23A	P54725	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	FOXL1	Q12952	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ECH1	Q13011	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	DOK3	Q7L591	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P4HB-215	ENST00000571507	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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