RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568569.1

GTF3C1-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-209ENST00000568569 OR10A6Q8NH74 314 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 EBF4Q9BQW3 602 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 SIRPDQ9H106 197 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 TMEM100Q9NV29 134 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CTSZQ9UBR2 303 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 BAG5Q9UL15 447 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 XKRYO14609 159 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 AHCYL1O43865 530 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM20BO75063 409 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 HLA-DPB1P04440 258 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 IFI30P13284 250 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 TGFBR2P37173 567 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 MAB21L1Q13394 359 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 VMACQ2NL98 169 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 MICU2Q8IYU8 434 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 OR51A7Q8NH64 312 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 MRAPQ8TCY5 172 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 C7orf26Q96N11 449 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 PRSS37A4D1T9 235 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 LGALS8O00214 317 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ANGPT2O15123 496 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 RER1O15258 196 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ADAM20O43506 726 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FBP1P09467 338 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CTLA4P16410 223 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FUT4P22083 530 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CD200P41217 278 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 OR1E2P47887 323 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 RAD23AP54725 363 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ST3GAL3Q11203 375 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 COX10Q12887 443 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 NFYCQ13952 458 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 OTPQ5XKR4 325 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 Q6ZTK2 550 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 OAFQ86UD1 273 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ECSITQ9BQ95 431 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 WDR76Q9H967 626 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 A0A1B0GVI7 797 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 NDUFA2O43678 99 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CD14P08571 375 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 IFNA8P32881 189 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 RPL4P36578 427 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 SLC9A3P48764 834 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ARF6P62330 175 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FHL1Q13642 323 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 HERPUD1Q15011 391 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 OR8B8Q15620 311 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 MPPED2Q15777 294 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 CDONQ4KMG0 1287 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 MESTQ5EB52 335 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 NRMQ8IXM6 262 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM156AQ8NDB6 213 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 PRRC1Q96M27 445 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF583Q96ND8 569 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF570Q96NI8 536 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 COQ7Q99807 217 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 RNF7Q9UBF6 113 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 KPTNQ9Y664 436 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C1-209ENST00000568569 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms