RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 ENTPD6O75354 484 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLIC3O95833 236 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LYNP07948 512 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC2A1P11166 492 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 NAT2P11245 290 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRSS12P56730 875 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 Q5PR19 223 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 GID4Q8IVV7 300 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF799Q96GE5 643 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPK1Q9H3S4 243 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITPR3Q14573 2671 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRR32B1ATL7 298 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF878C9JN71 531 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 H0YHG0 523 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSMD9O00233 223 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC16A6O15403 523 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LCATP04180 440 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 GABRB1P18505 474 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALOX5APP20292 161 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCH1P30793 250 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HTR1FP30939 366 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC6A9P48067 706 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 EVX1P49640 407 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPTEP56180 551 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSG7Q13046 419 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 GGTLC2Q14390 218 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPTSSAQ969W0 71 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CMBLQ96DG6 245 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNJ15Q99712 375 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 BMP4P12644 408 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OPRL1P41146 370 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGS6P49758 472 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYGBQ8WWM9 190 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 M0R233 179 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SSX4O60224 188 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHV3-13P01766 116 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 H2BFMP0C1H6 154 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SBK2P0C263 348 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPOXP50336 477 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SELENOVP59797 346 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RDH12Q96NR8 316 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBX5Q99593 518 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRD7Q9NPI1 651 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSD11B1P28845 292 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC15A1P46059 708 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CX3CR1P49238 355 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUDT6P53370 316 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OCLNQ16625 522 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SSX6Q7RTT6 188 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 Q96MF0 132 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MMP15P51511 669 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFNA4P52798 201 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CXCR4P61073 352 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHEQ5VZ18 495 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2T2Q6IF00 324 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 DRAM2Q6UX65 266 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT77Q7Z794 578 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms