RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 BMP2P12643 396 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRB-209ENST00000550857 STSP08842 583 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 EPXP11678 715 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.23□□□□□ -1.25
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