RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FN3KQ9H479 309 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MCUBQ9NWR8 336 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 STMN3Q9NZ72 180 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SPG21Q9NZD8 308 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NUP50Q9UKX7 468 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NPTNQ9Y639 398 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LTBP2Q14767 1821 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A087WUU8 490 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GTQ1 180 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GVI7 797 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PPV9 198 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LEUTXA8MZ59 168 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CASKO14936 926 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF749O43361 778 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 VEGFDO43915 354 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PLOD3O60568 738 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HPGDSO60760 199 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SH3BGRLO75368 114 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SC5DO75845 299 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR5F1O95221 314 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GBAP04062 536 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CSF2P04141 144 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FHP07954 510 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IFI6P09912 130 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 NPR2P20594 1047 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NTSP30990 170 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EVI2BP34910 448 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 CD79BP40259 229 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RFX3P48380 749 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CASP9P55211 416 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R43P59537 309 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DCAF7P61962 342 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MXD1Q05195 221 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 HSPB3Q12988 150 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 P2RY14Q15391 338 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRAM1Q15629 374 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CEBPEQ15744 281 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF77Q15935 545 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SNAPC1Q16533 368 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SYPL1Q16563 259 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM215Q68D42 235 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OAFQ86UD1 273 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C17orf64Q86WR6 236 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC43A2Q8N370 569 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CADM2Q8N3J6 435 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TEX19Q8NA77 164 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TTLQ8NG68 377 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PIGXQ8TBF5 258 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OSTF1Q92882 214 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OTUB2Q96DC9 234 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NUS1Q96E22 293 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 COX14Q96I36 57 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR2M2Q96R28 347 aa3.55□□□□□ -1.84
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