RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	FBXW4	P57775	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DGCR2	P98153	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSF1	Q00613	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CD83	Q01151	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MC2R	Q01718	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAP	Q12884	760 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CDK10	Q15131	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR7A5	Q15622	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	EXT1	Q16394	746 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MEP1B	Q16820	701 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OPN5	Q6U736	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		R4GMQ9	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A087WZY1	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A0A6YYH2	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A0B4J293	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1B0GVC2	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1W2PNV4	684 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A6NIN4	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808		A6NJ64	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SULT1C2	O00338	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC17A2	O00624	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ADAM10	O14672	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	XRCC3	O43542	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	LANCL1	O43813	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBBP9	O75884	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHE	P01854	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MAS1	P04201	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ISG15	P05161	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CSF1	P09603	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ANXA3	P12429	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNGR1	P15260	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CTLA4	P16410	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACHE	P22303	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GIF	P27352	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PTGS2	P35354	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	GZMK	P49863	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	TAS2R20	P59543	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FOXF1	Q12946	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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