RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ING4	Q9UNL4	249 aa		6.05	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	B9D1	Q9UPM9	204 aa		6.05	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR45	Q9Y484	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		6.05	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM129	A0AVI4	362 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	C20orf202	A1L168	122 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC182	A6NF36	153 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPB2	A8KAH6	182 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L23	D6RBM5	183 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BSA7	217 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		M0R143	59 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HPGDS	O60760	199 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF217	O75362	1048 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2J3	O76001	311 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CLDN9	O95484	217 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CBX6	O95503	412 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf105	O95561	183 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ORM1	P02763	201 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	AMY2A	P04746	511 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ERG	P11308	486 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ACP5	P13686	325 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	IL9	P15248	144 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	AMY2B	P19961	511 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FUT3	P21217	361 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPH2	P23942	346 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	EPHA3	P29320	983 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNGR2	P38484	337 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB5C	P51148	216 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CAV2	P51636	162 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RRAD	P55042	308 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXA1	P55317	472 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PFN3	P60673	137 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2K	P61086	200 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ERVK11-1	P61568	191 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SIRPA	P78324	504 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RGS1	Q08116	209 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	NFATC4	Q14934	902 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPB2	Q16082	182 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PYCR3	Q53H96	274 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		Q7L0L9	218 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC34A3	Q8N130	599 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5J2	Q8NH18	312 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CLDN23	Q96B33	292 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR34	Q96EX3	536 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF347	Q96SE7	839 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FGF21	Q9NSA1	209 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ASIC5	Q9NY37	505 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SPANXC	Q9NY87	97 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	STUB1	Q9UNE7	303 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GTL3	188 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GW55	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CPED1	A4D0V7	1026 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	WIPF3	A6NGB9	483 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		M0R3G1	203 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FAAH	O00519	579 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	EI24	O14681	340 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	GYG2	O15488	501 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SSNA1	O43805	119 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC14B	O60729	498 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RCBTB2	O95199	551 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SEMA4F	O95754	770 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SFTPB	P07988	381 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	IMPA1	P29218	277 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	GDF5	P43026	501 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	NXPH1	P58417	271 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PLP1	P60201	277 aa		6.03	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SELENOT	P62341	195 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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