RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492827.1

MTRF1-208, Transcript of mitochondrial translation release factor 1, human

TSL 3

Gene MTRF1, Length 618 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTRF1-208	ENST00000492827	CEL	P19835	753 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	IL32	P24001	234 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TALDO1	P37837	337 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CDK5	Q00535	292 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	SELENBP1	Q13228	472 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ART3	Q13508	389 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	DGCR6	Q14129	220 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	KIR2DS1	Q14954	304 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	NPW	Q8N729	165 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	NUBPL	Q8TB37	319 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	DUX4	Q9UBX2	424 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	PALLD	Q8WX93	1383 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		2.58	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	C5orf63	A6NC05	138 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	SOCS1	O15524	211 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CHMP2A	O43633	222 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CDRT1	O95170	752 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	AGT	P01019	485 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CD74	P04233	296 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	KIR3DL2	P43630	455 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CCNG1	P51959	295 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	RCN1	Q15293	331 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CHRNA6	Q15825	494 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	PGGHG	Q32M88	737 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	GSDMA	Q96QA5	445 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	NEK6	Q9HC98	313 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	RETN	Q9HD89	108 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MED4	Q9NPJ6	270 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827		S4R3C0	116 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		2.57	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	FLOT1	O75955	427 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	KRT14	P02533	472 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	BCKDHB	P21953	392 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ME2	P23368	584 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CCNA1	P78396	465 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	SEMG2	Q02383	582 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	LIPE	Q05469	1076 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TTL	Q8NG68	377 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CHP1	Q99653	195 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	RBBP8	Q99708	897 aa		2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	GABRR3	A8MPY1	467 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ERLIN1	O75477	346 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CCNB2	O95067	398 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OR1E1	P30953	314 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	UQCRFS1	P47985	274 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	CRISP1	P54107	249 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ZNF616	Q08AN1	781 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	LRRC66	Q68CR7	880 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	LUZP2	Q86TE4	346 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	BEX1	Q9HBH7	125 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	TMEM165	Q9HC07	324 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		2.55	□□□□□ -2
MTRF1-208	ENST00000492827	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2

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