RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0B4J2E0 115 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GX12 115 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PIN1P1O15428 100 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 B3GALNT1O75752 331 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PATE4P0C8F1 98 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 CNR1P21554 472 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMB6P28072 239 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 SDHAP31040 664 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 RFC3P40938 356 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 OR1D5P58170 312 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 DPTQ07507 201 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZS52 159 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 MITD1Q8WV92 249 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 GIMAP5Q96F15 307 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 GPHA2Q96T91 129 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.16□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 SMCO3A2RU48 225 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 NPIPB8E9PQR5 432 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 EFSO43281 561 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 CTAG2O75638 210 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PMS2P2O95744 297 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 ZP1P60852 638 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF141Q8WVD5 230 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 MR1Q95460 341 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2A5Q96R48 311 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PBX4Q9BYU1 374 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 CTSFQ9UBX1 484 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 LCTP09848 1927 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 ZFP92A6NM28 416 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 SULT1C2O00338 296 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 CLDN17P56750 224 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 RAB38P57729 211 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PSG6Q00889 435 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 MGAT2Q10469 447 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 BAP18Q8IXM2 172 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 CA13Q8N1Q1 262 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 CUTCQ9NTM9 273 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.15□□□□□ -0.62
TRIOBP-211ENST00000492485 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 25.3
TRIOBP-211ENST00000492485 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MEGF11A6BM72 1044 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RAD51DO75771 328 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QL1O75973 258 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HLA-DOBP13765 273 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 CRABP1P29762 137 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ACSM1Q08AH1 577 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR84Q9NQS5 396 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LRFN1Q9P244 771 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MYLKQ15746 1914 aa11.15□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PR64 198 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PRV1 198 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 CST7O76096 145 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 IL33O95760 270 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HSD11B2P80365 405 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LILRA6Q6PI73 481 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A28Q96A46 364 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAM11O75078 769 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 THBS1P07996 1170 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ARL5BQ96KC2 179 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 FOXQ1Q9C009 403 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.14□□□□□ -0.63
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