RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MIOX	Q9UGB7	285 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TRIP11	Q15643	1979 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PLXNB2	O15031	1838 aa		3.4	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809		A0A0D9SG52	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809		A0A1W2PRQ8	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM218	A2RU14	115 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809		A8MXE2	369 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GABARAP	H6UMI1	98 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RNF13	O43567	381 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	STK16	O75716	305 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NDUFB6	O95139	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	NGF	P01138	241 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IFNA10	P01566	189 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GP1BA	P07359	652 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C8G	P07360	202 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ANXA5	P08758	320 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ALPI	P09923	528 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LAMP1	P11279	417 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GP1BB	P13224	206 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	EPOR	P19235	508 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MPZ	P25189	248 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	HTR1F	P30939	366 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87	2e-11	■■□□□ 12
HBP1-211	ENST00000483809	PTGER4	P35408	488 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IFNGR2	P38484	337 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CD79B	P40259	229 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ACTR1B	P42025	376 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PTGFR	P43088	359 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CRAT	P43155	626 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR1E2	P47887	323 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC6A12	P48065	614 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	KCNJ3	P48549	501 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CCR8	P51685	355 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CAPZA1	P52907	286 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	BACE1	P56817	501 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	STARD6	P59095	220 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SPCS3	P61009	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ACTR1A	P61163	376 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	TNFRSF17	Q02223	184 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IHH	Q14623	411 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SMCO1	Q147U7	214 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PEA15	Q15121	130 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MAPK14	Q16539	360 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MPPE1	Q53F39	396 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	WSCD1	Q658N2	575 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ADCK2	Q7Z695	626 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC43A2	Q8N370	569 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HBP1-211	ENST00000483809	THEM6	Q8WUY1	208 aa		3.39	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms